從制藥純化水系統(tǒng)功能角度來看，制藥純化水的組成部分包括制備單元和儲存及分配單元。制藥純化水的制備單元由預(yù)處理系統(tǒng)以及純化水機組成，其功能在于連續(xù)、穩(wěn)定地將原水“凈化”使出水水質(zhì)能夠符合企業(yè)內(nèi)控指標或者藥典要求。而儲存及分配系統(tǒng)由儲存單元、分配單元和用點水管網(wǎng)單元組成，其主要功能是在一定的壓力、流量和溫度下，將制藥用純化水輸送到所需的工藝崗位，并維持水質(zhì)始終符合藥典要求。

　　值得注意的是，制藥純化水系統(tǒng)的本質(zhì)就減少或者消滅潛在的污染源。而制藥用純化水既可以作為原料又可以作為清洗用水，且極其容易滋生微生物，故微生物指標是制藥行業(yè)重要的指標之一。基于對風險的控制，在制藥用純化水系統(tǒng)的設(shè)計、安裝、驗證、運行和維護過程中需要采取有效的措施抑制系統(tǒng)內(nèi)微生物的滋生。除此之外，由于制藥用純化水與產(chǎn)品直接接觸，直接影響到產(chǎn)品的質(zhì)量，各國藥典將制藥用純化水系統(tǒng)視為制藥生產(chǎn)中的關(guān)鍵系統(tǒng)并實行嚴格質(zhì)量控制，同時對純化水的質(zhì)量標準和用途也提出了明確的要求。